Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rpl35aO55142 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rpl35aO55142 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms