Protein–RNA interactions for Protein: O55123

Mmp10, Stromelysin-2, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp10O55123 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mmp10O55123 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mmp10O55123 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms