Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr1O55100 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms