Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trappc3O55013 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trappc3O55013 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms