Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SlkO54988 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SlkO54988 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SlkO54988 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SlkO54988 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SlkO54988 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SlkO54988 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SlkO54988 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SlkO54988 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SlkO54988 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SlkO54988 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SlkO54988 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlkO54988 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlkO54988 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SlkO54988 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlkO54988 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlkO54988 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SlkO54988 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlkO54988 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlkO54988 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlkO54988 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SlkO54988 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SlkO54988 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SlkO54988 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SlkO54988 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SlkO54988 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SlkO54988 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SlkO54988 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SlkO54988 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SlkO54988 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SlkO54988 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms