Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NlkO54949 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NlkO54949 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NlkO54949 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
NlkO54949 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms