Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Zmat3O54836 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Zmat3O54836 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms