Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DffaO54786 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DffaO54786 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DffaO54786 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DffaO54786 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DffaO54786 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DffaO54786 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DffaO54786 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
DffaO54786 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
DffaO54786 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DffaO54786 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DffaO54786 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DffaO54786 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DffaO54786 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DffaO54786 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
DffaO54786 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DffaO54786 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DffaO54786 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DffaO54786 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DffaO54786 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DffaO54786 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DffaO54786 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DffaO54786 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DffaO54786 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DffaO54786 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DffaO54786 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DffaO54786 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DffaO54786 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DffaO54786 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DffaO54786 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DffaO54786 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DffaO54786 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DffaO54786 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DffaO54786 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DffaO54786 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DffaO54786 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DffaO54786 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DffaO54786 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DffaO54786 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DffaO54786 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DffaO54786 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DffaO54786 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DffaO54786 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DffaO54786 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DffaO54786 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DffaO54786 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DffaO54786 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms