Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Srpk2O54781 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Srpk2O54781 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srpk2O54781 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srpk2O54781 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srpk2O54781 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srpk2O54781 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srpk2O54781 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Srpk2O54781 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srpk2O54781 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srpk2O54781 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms