Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdk5r2O35926 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cdk5r2O35926 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms