Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Klf9O35739 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klf9O35739 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Klf9O35739 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Klf9O35739 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms