Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf18O35714 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf18O35714 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf18O35714 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf18O35714 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf18O35714 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf18O35714 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf18O35714 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tnfrsf18O35714 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tnfrsf18O35714 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms