Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ppfibp2O35711 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms