Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Stag2O35638 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stag2O35638 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stag2O35638 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stag2O35638 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Stag2O35638 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms