Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Edil3O35474 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edil3O35474 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edil3O35474 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edil3O35474 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edil3O35474 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edil3O35474 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edil3O35474 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Edil3O35474 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edil3O35474 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edil3O35474 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Edil3O35474 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms