Protein–RNA interactions for Protein: O35453

Hpn, Serine protease hepsin, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpnO35453 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpnO35453 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HpnO35453 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpnO35453 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpnO35453 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpnO35453 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpnO35453 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpnO35453 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpnO35453 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HpnO35453 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HpnO35453 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HpnO35453 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HpnO35453 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HpnO35453 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpnO35453 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpnO35453 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpnO35453 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpnO35453 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpnO35453 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpnO35453 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpnO35453 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpnO35453 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpnO35453 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HpnO35453 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms