Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt1O35449 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prrt1O35449 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt1O35449 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt1O35449 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt1O35449 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt1O35449 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt1O35449 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt1O35449 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt1O35449 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt1O35449 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Prrt1O35449 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Prrt1O35449 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Prrt1O35449 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Prrt1O35449 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Prrt1O35449 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Prrt1O35449 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms