Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppt2O35448 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms