Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Kpna3O35344 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms