Protein–RNA interactions for Protein: O35324

Sh2d1b, SH2 domain-containing protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d1bO35324 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sh2d1bO35324 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sh2d1bO35324 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms