Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Bhlhe40O35185 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe40O35185 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms