Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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Nedd9O35177 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Nedd9O35177 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Nedd9O35177 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nedd9O35177 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Nedd9O35177 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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