Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scarb2O35114 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms