Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Eftud2O08810 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms