Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltaO08585 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltaO08585 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltaO08585 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltaO08585 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CltaO08585 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CltaO08585 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CltaO08585 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CltaO08585 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CltaO08585 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CltaO08585 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CltaO08585 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CltaO08585 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CltaO08585 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CltaO08585 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms