Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm20878L7N244 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Gm20878L7N244 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm20878L7N244 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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