Protein–RNA interactions for Protein: J3QN10

Gm16434, Predicted gene 16434, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16434J3QN10 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm16434J3QN10 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm16434J3QN10 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms