Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gm6594J3QM43 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gm6594J3QM43 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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