Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Cldn34c3J3QJW5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Cldn34c3J3QJW5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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