Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Pabpc4lG5E8X2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pabpc4lG5E8X2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms