Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tubgcp6G5E8P0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tubgcp6G5E8P0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms