Protein–RNA interactions for Protein: G5E870

Trip12, E3 ubiquitin-protein ligase TRIP12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip12G5E870 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Trip12G5E870 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Trip12G5E870 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms