Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pcf11G3X9Z4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pcf11G3X9Z4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms