Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cldn34aG3UW52 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cldn34aG3UW52 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms