Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Usp9yF8VPU6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Usp9yF8VPU6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms