Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arid4aF8VPQ2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Arid4aF8VPQ2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms