Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-M1F7CXU4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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H2-M1F7CXU4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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