Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm6482F6YHC1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms