Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rhox13F6YCR7 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox13F6YCR7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox13F6YCR7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox13F6YCR7 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox13F6YCR7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox13F6YCR7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox13F6YCR7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox13F6YCR7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox13F6YCR7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox13F6YCR7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rhox13F6YCR7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms