Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pagr1bF6V0H0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pagr1bF6V0H0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms