Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Syngap1F6SEU4 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms