Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm5407E9Q7Q1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm5407E9Q7Q1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms