Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col22a1E9Q7P1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col22a1E9Q7P1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms