Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Urb2E9Q7L1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Urb2E9Q7L1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Urb2E9Q7L1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms