Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Simc1E9Q6E9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Simc1E9Q6E9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms