Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf11E9Q6E5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms