Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BC005561E9Q5E2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
BC005561E9Q5E2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms