Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm20518E9Q548 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm20518E9Q548 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms