Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930579F01RikE9Q3L6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms