Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Vmn1r238E9Q373 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Vmn1r238E9Q373 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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Vmn1r238E9Q373 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Vmn1r238E9Q373 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r238E9Q373 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r238E9Q373 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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